High-Throughput Sequencing of RNA Silencing-Associated Small RNAs in Olive (Olea europaea L.)

Small RNAs (sRNAs) of 20 to 25 nucleotides (nt) in length maintain genome integrity and control gene expression in a multitude of developmental and physiological processes. Despite RNA silencing has been primarily studied in model plants, the advent of high-throughput sequencing technologies has enabled profiling of the sRNA component of more than 40 plant species. Here, we used deep sequencing and molecular methods to report the first inventory of sRNAs in olive (Olea europaea L.). sRNA libraries prepared from juvenile and adult shoots revealed that the 24-nt class dominates the sRNA transcriptome and atypically accumulates to levels never seen in other plant species, suggesting an active role of heterochromatin silencing in the maintenance and integrity of its large genome. A total of 18 known miRNA families were identified in the libraries. Also, 5 other sRNAs derived from potential hairpin-like precursors remain as plausible miRNA candidates. RNA blots confirmed miRNA expression and suggested tissue- and/or developmental-specific expression patterns. Target mRNAs of conserved miRNAs were computationally predicted among the olive cDNA collection and experimentally validated through endonucleolytic cleavage assays. Finally, we use expression data to uncover genetic components of the miR156, miR172 and miR390/TAS3-derived trans-acting small interfering RNA (tasiRNA) regulatory nodes, suggesting that these interactive networks controlling developmental transitions are fully operational in olive

CIBERER : Spanish national network for research on rare diseases: A highly productive collaborative initiative

Altres ajuts: Instituto de Salud Carlos III (ISCIII); Ministerio de Ciencia e Innovación.CIBER (Center for Biomedical Network Research; Centro de Investigación Biomédica En Red) is a public national consortium created in 2006 under the umbrella of the Spanish National Institute of Health Carlos III (ISCIII). This innovative research structure comprises 11 different specific areas dedicated to the main public health priorities in the National Health System. CIBERER, the thematic area of CIBER focused on rare diseases (RDs) currently consists of 75 research groups belonging to universities, research centers, and hospitals of the entire country. CIBERER's mission is to be a center prioritizing and favoring collaboration and cooperation between biomedical and clinical research groups, with special emphasis on the aspects of genetic, molecular, biochemical, and cellular research of RDs. This research is the basis for providing new tools for the diagnosis and therapy of low-prevalence diseases, in line with the International Rare Diseases Research Consortium (IRDiRC) objectives, thus favoring translational research between the scientific environment of the laboratory and the clinical setting of health centers. In this article, we intend to review CIBERER's 15-year journey and summarize the main results obtained in terms of internationalization, scientific production, contributions toward the discovery of new therapies and novel genes associated to diseases, cooperation with patients' associations and many other topics related to RD research

Effects of tetraploidy on olive floral and fruit biology

Floral biology and fruit development were studied in Leccino Compact (LC), a polyploid olive mutant of cultivar Leccino (L). This mutant, considered a mixoploid with both diploid and tetraploid cells, has thicker leaves and fruit size similar to the diploid cultivar. So far, no information is available on its floral biology. In this study,the ploidy level ofthe LC fruit epicarp, analyzed by flow cytometry, was determined to be tetraploid. Pollen size distribution confirmed that most flowers were tetraploid. Morphological and histological measurements of various floral structures and fruits were carried out on the two genotypes, and LC showed larger floral structures (i.e. rachis, flower and ovary) and slightly higher pistil abortion rates. The total number of flowers per inflorescence was not significantly different between L and LC. The large difference (about 2 fold) in ovary cross sectional area between LC and L ovaries was mainly due to increased cell size. LC had slightly larger fruit cross-sectional area (but not greater fruit volume, since LC fruits were less elongated), with much larger cells. Therefore tetraploidy resulted in larger floral structures, as normally occurs in tetraploid plants, but had little effect on fruit size, despite much larger cell size

Anales de Edafología y Agrobiología Tomo 41 Número 1-2

Suelos. Mineralización del carbono y del nitrógeno en suelos forestales de Galicia, por R. M. de Anta y F. Díaz-Fierros.-- Características bioclimáticas de interés edafológico de las Sierras de Orce y María, por L J. Alias y J. Martínez Sánchez.-- Factores formadores de los suelos de la cuenca del río Dilar (Sierra Nevada), por R. Delgado Calvo-Flores, E. Barahona y J. Linares.-- Distribución de los suelos de la cuenca alta del río Dilar (Sierra Nevada), por R. Delgado Calvo-Flores, E. Barahona y J. Linares.-- Los mollisoles de la cuenca alta del río Dilar (Sierra Nevada), por R. Delgado Calvo-Flores, E. Barahona, F. Huertas y J. Linares.-- Los inceptisoles de la cuenca alta del río Dilar (Sierra Nevada), por R. Delgado CalvoFlores, E. Barahona, F. Huertas y J. Linares.-- Los entisoles de la cuenca alta del río Dilar (Sierra Nevada), por R. Delgado Calvo-Flores, E. Barahona, F. Huertas y J. Linares.-- Aspectos edafogeoquímicos de la salinidad en la submeseta Sur (Toledo). l. Estudio hidrogeoquímico, por J. Gumuzzio Fernández, J. Astudillo Pastor y J. Batlle Sales.-- Modelo experimental de alteración de oligisto. Aplicación al estudio óptico de minerales opacos, por Hoyos de Castro, A., Remando Costa, J., Remando Massanet, l. y Millán Pérez, R.-- Modelo experimental de alteración de feldespatos. Aplicación de tinción. l. Ortosa. por Hoyos de Castro, A., Hernando Massanet, l. Remando Costa, J. y Yunta, M. V..-- Modelo experimental de alteración de feldespatos. Aplicación al método de tinción. II Labradorita, por Hoyos de Castro, A. Hernando Massanet, I., Hernando Costa, J. y Pisonero Ruiz, L.-- Taxonomía númerica. Su aplicación a la clasificación de los suelos rojos españoles, por L. Alcalá del Olmo, B. y F. Monturiol Rodríguez.-- Propiedades químicas de suelos y niveles de nutrientes inorgánicos en aciculas de A. Pinsapo de Grazalema (Cádiz España), por Paneque, G. y Corral, L.-- Morfología y propiedades químicas de suelos forestales de Granlema (Cádi7., España). l. Suelos bajo Quercus rotundifoliae y Quercus fagineae, por, C. Benírez, J. Mérida, L. Corral y G. Paneque.-- Morfología y propiedades químicas de suelos forestales de Grazalema (Cádiz, España). II. Suelos bajos Quercus suber y A bies pinsapo, por C. Benírez, J. Mérida, L. Corral y G. Paneque.-- Morfología y propiedades químicas de suelos forestales de Grazalema (Cádiz,España). III. Tipovergencia del perfil húmico, por J. Mérida, L. Corral y G. Paneque.-- Fertilidad de Suelos. Q/1 ratio saline soils belongig to Ebro Valley (Spain), por Benigna Elizalde and M. Fernández.-- Fertilidad química de los suelos del valle del río Guadalhorce (Málaga), por S. Bruque, M. Martínez Lara y L. Moreno Real.-- Absorción de K por ryegrass y Trifolium en suelos deficientes, por J. A. Diez.— Nutrición y Fisiología Vegetal. Correlaciones entre bioelementos: Estudio realizado en Trifo/ium subrerraneo L. y A vena saliva L., por Gómez Gutiérrez, J. M. y Hoyos Alonso, C. de.-- Influencia del ácido húmico sobre la nutrición mineral y el desarrollo radicular de plantas de maíz cultivadas en soluciones nutritivas normales y carentes de Fe y Mn, por Fortún, C. y López-Fando, C.-- Notas.-- BibliografíaPeer reviewe

Anales de Edafología y Agrobiología Tomo 42 Número 9-10

Suelos. Dispositivo de incubacion para el estudio. de la mineralización de la materia organíca del suelo, por A. Polo, G. Almendros y E. Dorado.-- Evolución de algunas variables edáficas en relación con la sucesión secundaria, por A. Puerto, M. Rico y J.M. Gómez Gutierrez.-- Los suelos de la cuenca baja del rio Guadalhorce (Málaga). I.-Arenosoles y vertisoles, por L. Moreno Real, E. Barahona, M. Martínez Lara y S. Bruque.-- Los suelos de la cuenca baja del río Guadalhorce (Málaga). II. Cambisoles, por L. Moreno Real, M. Martínez Lara, E. Barahona y S. Bruque.-- Los suelos de la cuenca baja del río Guadalhorce (Málaga). III.-Luvisoles, por L. Moreno Real, E. Barahona, M. Martínez Lara y S. Bruque.-- Mineralogía de la fracción arcilla de ocho perfiles de suelos de Málaga, por L. Moreno Real, A. Rodriguez García, S. Bruque y M. Martínez Lara.-- Aspectos edafogeoquímicos de la salinidad en la submeseta sur (Toledo). II.-Estudio edafogeoquímico, por J. Gumuzzio Femández, J. Astudillo Pastor y A. Moreno Gutierrez. Procesos de alteración, génesis y estabilidad mineral de suelos volcánicos (volcán de Piedrabuena, Ciudad Real). IV .-Mineralogía y génesis de las arcillas, por Martín de Vida/es, J.L. Sanz, J., Casas, J. y Hoyos, M.A.-- Suelos AC sobre granitos de Galicia (N.O. de España) con especial referencia al ranker atlántico. II.-Propiedades químicas, por Carballas, M., Guitian Ojea, F., Carbalas, T.-- Micro flora y materia orgánica reconocible er. suelos de pradería. III.-Estaciones mesó filas. Conclusiones generales, por M. Carballas, O. Reisinger y G. Kilbertus.-- Factores formadores de los suelos del sector salar-alhama (Granada), por E. Ortega, J. Parraga, J. Femández y G. Marín.-- Algunos suelos halomorfos de el pedernoso (Cuenca), por L. J. Alias y A. Sánchez.-- Haploxerolls de la sierra de orce (Granada, Almería), por L. J. Alias y J. Martínez.--Formaciones edáficas de la región de Ocaña (Toledo). II. Inceptisoles y alfisoles, por José Gumuzzio Fernández.-- Fertilidad de Suelos. Intensidad relativa del potasio en suelos del valle inferior del río colorado, por María Luisa Reyzaba y Julio Cesar Lucero.-- Balance de nutrientes en el suelo en dos tipos de rotación T--c-B y T-e-V. 1 Potasio, por J.A. Díez.-- Balance de nutrientes en el suelo en dos tipos de rotación T--c-B y T--c-v. II Fósoforo, por J. A. Diez . El Pinus radiata d. don en Chile, ensayos de fertilización con cobre y boro, por C. González, V. Konow y M. Lachica.—Nutrición y Fisiología Vegetal. Balance aniónico en savia de peciolos foliares de plantas de tomate en función de su posición en la planta, por C.F. Alcaraz, F. Martínez, F. Romojaro, y J.L. Giménez .-- Crecimiento y nutrición del trévol violeta, en la fase exponencial del crecimiento primario: 11 Nutrición, por R. Fabregas y J. Arines.-- Análisis rápido de especies herbaceas por espectroscopia de la reflectancia en el infrarrojo cercano, por A. García Ciudad, B. García Criado e l. García Bellido.-- Influencia de la irradiación UV-A sobre la actividad IAA-oxidasa en plantas de ononis spinosa L.: relación con los contenidos endógenos de determinados flavonoides, por J. Baztan.-- Efectos de las deficiencias de N, P, K y Mg sobre el ciclo de desarrollo y el contenido de nicotina en nicotiana rústica", por M.A. Díez, J. Barceló, y F. Lopez-Belmonte.-- Efectos de las deficiencias de N, P, K y Mg sobre el ciclo de desarrollo y el contenido de nicotina en ''ni· cotiana tabacum ", por M. A. Díez, J. Barceló y F. Lopez-Belmonte.-- Efectos de las deficiencias de N, P, K y Mg sobre el ciclo de desarrollo y el contenido de atropina de "hyoscyamus albus", por M.0 A. Díez, J. Barceló y F. Lopez-Belmonte.-- Evolución del contenido de flavonoides en hoja de vid, CV. airen, durante la fructificación, por J.J. Mataix, E. Revilla y O. Carpena.-- Influencia de la relación NO:J/NH4 en la nutrición mineral de la planta de tomate, por O. Carpena Artes, P. Zomoza y R.O. Carpena Ruiz.-- Dinámica del fósforo en los suelos de las marismas del río Guadalquivir, por T. Luque y P. de Arambarri. Nota previa.-- Los suelos de la cuenca baja del río Guadalhorce (Málaga). IV Análisis factorial de la varianza de parámetros analíticos, por L. Moreno Real, M. Martínez Lora, E. Barahona y S. Bruque.-- Trabajo precapitulativo. Las clases de fosfatos, su disponibilidad en suelos agrícolas y otros trabajos relacionados con el elemento fósforo. Parte l. métodos analíticos, fósforo disponible y clases de fosfatos, por P. de Arambarri.Peer reviewe